只为让您轻松做科研,成为更好的临床医生。
您现在的位置:首页 > 学习教程
如何利用PubMed检索医学文献
发布时间:2014-09-24 14:57:20  浏览次数:0

        PubMed(http://www.ncbi.nlm.nih.gov/PubMed)是由美国国家医学图书馆(National Library of Medicine,NLM)附属的国家生物技术信息中心(National Center for Biotech-nology Information,NCBI)开发研制的生物医学文献检索系统。1997年6月,PubMed在网上向用户提供免费检索服务。PubMed文献量大、更新及时、检索途径多样、功能齐全、链接点多,部分期刊还可在网上直接免费获得原文,深受用户欢迎。现在网上运行的是2003年8月改版的新版PubMed。改版后的PubMed界面直观、容易操作,检索程序简单,功能强大,很容易被使用者掌握。目前,PubMed已经成为国内医药卫生工作者使用的主要外文文献检索数据库。为了便于用户更好地利用PubMed,本文将其检索方法与技巧作一介绍。
        1、PubMed检索方法
        1.1自动词语匹配检索
        新版PubMed提供了强大的词语自动转换和匹配功能(Automatic Term Mapping),该功能通过4个词表来实现,即MeSH转换表、刊名转换表、短语列表以及着者索引表[1]。在检索提问框中输入检索词,如果没有设定字段,系统会依次在这4个表中进行词语的核对、转换和检索。当在其中一个表中找到了相匹配的检索词时,系统会利用该匹配词和用户输入的检索词在相应的字段中进行检索,检索结果直接显示在下方。其检索式可在细节(Details)中查看。如果没有找到相匹配的词语,系统会将词语拆小,用AND将断开的词组或单词组配起来在上述各表中进行检索。如果仍找不到相匹配的词,系统将这些组配后的词于所有字段中进行检索。
        1.2组配与字段限定检索
        PubMed为用户提供了运算符AND、OR和NOT的逻辑组配运算功能,使用时,这3个运算符要大写。每组检索词可以限定检索字段,即要求检索词出现在指定的字段中,字段符号要括在方括号内(常用字段见表1)。如:要检索作者GongHP在期刊Clinical drug investigation上发表的题名中含有“olme sartanm edoxomil”方面的文章,其组配方式是:Gong HP[au]AND Clinical drug investigation[ta]AND olme sartan medoxomil[ti]。应当注意的是,限定字段后,系统将不再执行自动匹配和转换功能。

4333.jpg


        1.3强制检索
        PubMed的字段限定检索功能,只能限定检索词必须出现在指定的检索字段中,如Smith J [au],可检索出姓名为Smith J,Smith JH,Smith JP等作者发表的文章。同样,在刊名检索时,如用Cancer[ta]检索期刊“Cancer”的文献,系统会将刊名为“Cancer”、“BMC Cancer”、“Nat RevCancer‘,等的文献检索出来。强制检索就是精确检索某一个或某一组检索词,检索时用双引号将检索词引起来,并在其后加上相应的字段符号,系统会将其作为一个不可分割的词组在数据库的相应的字段中进行精确检索,如”Smith J“[au]。使用双引号检索时,系统会自动关闭词汇转换功能。
        2PubMed的特殊服务功能
        在PubMed界面左侧,设置了多项特殊服务功能,对用户的特殊要求提供服务。其检索项目有:主题词检索、期刊信息检索、单一引文匹配、批引文匹配、临床文献查询、包厢服务等[2]。
        2.1主题词检索
        已知主题词时,可以直接在检索输入框中输入主题词。检索规则遵循”主题词+[mesh]或[mh]“的格式。
        当不确定主题词或者要了解主题的相关内容时,可以点击PubMed左侧框中的(MeSH Database)超级链接进入MeSH表。在检索框中键入检索词,系统会自动将其转换为主题词或相应的MeSH词显示出来供用户选择。双击选定的主题词,系统会显示与该主题词组配的多个副主题词以及这个主题词的树状结构表。将需要的副主题词前的复选框激活(可同时选择多个),点击页面上方的”Sendto“下拉按钮中的逻辑运算符,系统便自动完成检索式的组配。再单击”PubMed Search“按钮,系统会将检索式自动添加到PubMed的检索框内并直接完成检索。例如,在MeSHDatabase中输入”anticancer drug combinations“进行检索,系统将显示相应的主题词”Antineo_plastic Combined Chemotherapy Protocols“。激活副主题词pharmacokinetics和pharmacology使之完成组配检索,便可查到检索式为”Antineoplastic Combined Chemotherapy Prot_ocols/pharmacokinetics“[mesh]OR”Antineoplastic Combin_ed Chemotherapy Protocols/pharmacology“[mesh]的文献。
        另外,该表的树状结构还可以帮助检索者扩大或缩小检索范围。
        2.2引文检索
        当根据参考文献中的引文信息检索文献时,可以点击PubMed左侧的单引文匹配器(Single Citation Matcher)或批引文匹配器(Batch Citation Matcher)进入检索界面。按照检索格式填入已知信息,即可检索到所需要的文献。
        2.3期刊信息检索
        点击”Journals Database“,可查询PubMed和Entrez其他数据库收录的期刊信息。该数据库的主要用途是进行刊名缩写和刊名全称转换的查询。还可以获得PubMed等收录的期刊一览(Entrex journals)及PubMed收录的全文电子期刊网站链接一览(links to full-text websites)。
        2.4临床文献查询
        临床文献查询(Clinical Queries)是一个专门为临床医师和临床试验工作者设计的检索服务。有3个方面的检索:(1)Searchby Clinical Study Category,供查询疾病的therapy(治疗)、diagnosis(诊断)、etiology(病因)和prognosis(预后)4个方面的文献。(2)Find Systematic Reviews,供检索疾病的systematic reviews(系统评论)、meta-analysis(分析),reviews of clinicaltrials(临床试验评论),evidence-based
        medicine(循证医学)等方面的文献。(3)Medical Genetics Searches,供检索医学遗传学方面的文献。
        3特征栏的使用
        3.1限定(Limits)
        点击”Limits“,系统进入限定状态,系统可显示多种限定条件供用户选择。有字段(作者、刊名、语种、主题词等)、出版类型(文献综述、社论、信件等)、出版日期、数据库选择(如AIDS、AIM、MEDLINE等)、特征词(人和动物、人、动物)。还可以检索出只带文摘的文献或出版机构站点提供的免费全文文献。
        3.2预览/索引(Preview/Index)
        该功能可用于预览检索策略和检索结果的记录数、修改检索策略、从索引表中浏览并选择检索词。点击''Preview/Index”,系统仅显示最后输入的3个检索策略和检索结果。点击“Result”下的记录数,即可显示检索结果。如果对检索结果不满意,可以在“AllFields”下拉菜单中选择一个检索字段,然后在提问框中输入检索词,点击“Index”,系统将显示相应字段的索引词汇字母顺序表,选择其中的一个检索词,然后点击合适的布尔逻辑运算符(AND、OR、NOT),被选择的词便会自动加进当前的检索式,然后点击“Preview”即可预览检索结果。
        3.3检索历史(history)
        检索历史主要用于查看检索策略和检索结果。检索历史包括检索号(如#1、#2)、检索式、检索时间、检索结果。在His-tory状态下,可以将检索号用逻辑运算符组配起来再检索,不必写全检索式,例如#1AND#2。PubMed最多可以保留100个检索式,超过100个时则自动删除最早的检索式。也可以用“ClearHistory”清除所有检索史。
        3.4粘贴板(Clipboard)
        Clipboard是用来暂时存放检索结果的地方,以便于集中打印、存盘或订购原文。存放方法:先标记要保存的文献,点击“Sendto”下拉菜单中的“Clipboard”即可将所选内容存放在粘贴板上。粘贴板最多可以存放500条记录,暂存时间为8小时。只要粘贴板上有记录,就可点击''Clipboard“查看其中的记录(记录的默认格式为Summary)。
        3.5细节(Details)
        该功能可查看检索词被PubMed的词语自动匹配功能、检索规则和句法转换后的形式。例如,检索者输入的检索词是”livercancer“,系统执行检索时会自动将检索式转换成”liverneoplasms“[tiab]NOTMedline[sb]OR”liverneoplasms“[meshterms]OR”livercancer“[textword]的形式,即PubMed实际使用的检索式。此外,还可以对Details中的检索式进行修改,重新检索。
        4检索结果的存盘与打印
        PubMed系统可用不同的格式保存检索结果。在”Sendto“下拉菜单中设有”Text“、”File“、”Clipboard'’都可以用来保存检索结果。保存前,先点击‘'Display'’下拉菜单中所需要的格式,然后在“Sendto”下选择保存方式,系统即可按所要求的格式进行存盘。
        如果已将检索到的文献集中存放在粘贴板中,可点击特征栏上的“Clipboard”,将粘贴板中的文献题目显示出来后,再选择合适的格式将其显示并打印出来。
        5检索PubMed上的免费全文
        要检索PubMed上的免费全文,最简单的方法是使用“Limits”限定检索。方法是:在检索输入框中键入检索词或检索式,点击“Limits‘,限定按钮,在该界面中选择”Links to free fulltext“进行标记,然后点击检索界面底端的”Go“按钮进行检索。用户可根据检索结果中的图标指引实现全文链接。
        另外,PubMed还提供多种形式的个性化服务,如MyNCBI服务、个性化馆藏信息服务以及个性化RSS服务等。

2014-09-24 14:57:20

关于我们 | 使用协议 | 联系我们 | 官方网店 | 免责声明
qiegan.com all rights reserved   © 2014-2016 冀ICP备14004650号-1